El equipo continuaría al mando de Sebastián Beccacece a pesar de los malos resultados obtenidos la temporada pasada. En su reemplazo llegaron Víctor Hugo Castañeda y Luis Musrri como dupla técnica, los cuales alcanzaron a estar solo hasta el final del Torneo de Apertura 2016, manchester city store principalmente por no lograr clasificar en cancha al equipo a un torneo internacional algo que generó críticas de Johnny Herrera hacía ambos DT y una fuerte disputa con el presidente del club Carlos Heller que casi lo hace tomar la decisión de dejar el club.